Pirmdiena, 2014. gada 11. augusts. Starptautiskā izmeklēšana, kurā piedalās Spānija, identificē mehānismu, ar kura palīdzību plaušu un kolorektālajos audzējos tiek ieviesti simtiem mutāciju.
Secību transdukcija DNS ir maz zināma parādība un tiek uzskatīta par retu parādību. Tās galvenā sastāvdaļa ir 50% no genoma, ko sauc par parazītu DNS, ko veido elementi, kas laiku pa laikam atkārtojas un migrē uz citām ģenētiskās secības vietām.
"Mēs esam novērojuši, ka īpaša veida sekvences pārnešana, kas saistīta ar genoma reģionu, ko sauc par LINE-1, ir diezgan bieža, it īpaši plaušu un resnās zarnas vēža genomos, " saka Hosē Tubio, pētnieks Wellcome Trust Sanger institūtā. Kembridža un raksta pirmais parakstītājs, kurš tiek publicēts žurnālā Science.
Kopā ar viņu un lielas starptautiskas pētnieku grupas ietvaros Kembridžā ir piedalījušies vēl četri spāņu zinātnieki: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora un Pablo Román.
Lai izdarītu šo secinājumu, pētnieki izstrādāja algoritmu, kas identificē un atrod mobilo LINE-1 elementu izcelsmi un jaunās atrašanās vietas.
"Zinot, kuriem mūsu genoma transponējamiem elementiem ir aktivitāte audzējos un kur tie slēpjas, tiek atvērtas durvis tādu zāļu izstrādei, kas apklusina šo 74 elementu mutagēno aktivitāti vēža gadījumā, neizmantojot plaša spektra zāles, kas var ietekmēt citus. genoma reģioni, "saka Romans, viens no darba līdzautoriem un šobrīd HUCA kaulu un minerālu metabolisma pētnieks.
No otras puses, "mēs atklājām, ka ir notikušas epiģenētiskas izmaiņas, kas saistītas ar pārvietojamo elementu migrāciju. Ņemot vērā, ka epiģenētiskās izmaiņas ir cieši saistītas ar vidi, šis darbs norāda uz jaunu attiecību veidu starp genomu un to, kā mēs ēdam un elpojam.", saka Romāns.
Pēc Tubio vārdiem, "būs jāveic vairāk pētījumu, lai atbildētu uz šī pētījuma uzdotajiem jautājumiem par mūsu novērotā mehānisma funkcionālām sekām, taču nav šaubu, ka šis atradums sniedz jaunu perspektīvu, kas interesē diagnozi un ārstēšanu. vēža ārsts. "
Avots:
Tags:
Labsajūta Savādāk Izrakstīšanās
Secību transdukcija DNS ir maz zināma parādība un tiek uzskatīta par retu parādību. Tās galvenā sastāvdaļa ir 50% no genoma, ko sauc par parazītu DNS, ko veido elementi, kas laiku pa laikam atkārtojas un migrē uz citām ģenētiskās secības vietām.
"Mēs esam novērojuši, ka īpaša veida sekvences pārnešana, kas saistīta ar genoma reģionu, ko sauc par LINE-1, ir diezgan bieža, it īpaši plaušu un resnās zarnas vēža genomos, " saka Hosē Tubio, pētnieks Wellcome Trust Sanger institūtā. Kembridža un raksta pirmais parakstītājs, kurš tiek publicēts žurnālā Science.
Kopā ar viņu un lielas starptautiskas pētnieku grupas ietvaros Kembridžā ir piedalījušies vēl četri spāņu zinātnieki: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora un Pablo Román.
Aktīvāko elementu atrašanās vieta
Pētnieki analizēja LINE-1 elementu mobilitāti 12 dažādu vēža veidu 300 genomos un novēroja, ka tikai 74 no 500 000 LINE-1 tipa transponējamu elementu, kas atrodas cilvēka DNS, spēj pārvietoties vēža genomos. .Lai izdarītu šo secinājumu, pētnieki izstrādāja algoritmu, kas identificē un atrod mobilo LINE-1 elementu izcelsmi un jaunās atrašanās vietas.
"Zinot, kuriem mūsu genoma transponējamiem elementiem ir aktivitāte audzējos un kur tie slēpjas, tiek atvērtas durvis tādu zāļu izstrādei, kas apklusina šo 74 elementu mutagēno aktivitāti vēža gadījumā, neizmantojot plaša spektra zāles, kas var ietekmēt citus. genoma reģioni, "saka Romans, viens no darba līdzautoriem un šobrīd HUCA kaulu un minerālu metabolisma pētnieks.
Pilnīgu gēnu mobilizācija
Kā novērojuši pētnieki, sekvences pārveidošana, kas rodas no LINE-1 elementu aktivitātes, dažkārt ietver pilnīgu gēnu mobilizāciju un to pārvietošanu uz citiem DNS reģioniem. Tādēļ tiek mainīta struktūra, gēnu skaits un genoma ekspresija.No otras puses, "mēs atklājām, ka ir notikušas epiģenētiskas izmaiņas, kas saistītas ar pārvietojamo elementu migrāciju. Ņemot vērā, ka epiģenētiskās izmaiņas ir cieši saistītas ar vidi, šis darbs norāda uz jaunu attiecību veidu starp genomu un to, kā mēs ēdam un elpojam.", saka Romāns.
Pēc Tubio vārdiem, "būs jāveic vairāk pētījumu, lai atbildētu uz šī pētījuma uzdotajiem jautājumiem par mūsu novērotā mehānisma funkcionālām sekām, taču nav šaubu, ka šis atradums sniedz jaunu perspektīvu, kas interesē diagnozi un ārstēšanu. vēža ārsts. "
Avots:
